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Carl von Ossietzky Universität Oldenburg
Wissenschaftliches Rechnen
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26127 Oldenburg 

Artikel

Newsletter September 2021

Der Newsletter des HPC-Teams vom September 2021

Liebe HPC-Nutzerinnen und -Nutzer,

wir haben für Sie einen weiteren Newsletter mit HPC-bezogenen Themen zusammengestellt. Die dritte Nachricht ist jedoch eine Ausnahme, denn dort geht es um den Bedarf an Tutoren für den kommenden Programmierkurs C++ (leiten Sie diese Information gerne auch an Nicht-HPC-Nutzer und -Nutzerinnen weiter).

  1. HPC-Kurs (Erinnerung): Der nächste dreitägige Kurs "Einführung in HPC" ist für den 20. bis 22. September von 10 bis 17 Uhr geplant. Der Kurs wird online auf BigBlueButton abgehalten, und das Programm für den gesamten Kurs sieht wie folgt aus:

    Tag 1 – Introduction to HPC (HPC Cluster, Job Scheduler, …)
    Tag 2 – Parallel Programming
    Tag 3 – Using Matlab on the HPC Cluster


    Daher richtet sich jeder Tag an ein anderes Publikum und es ist völlig in Ordnung, nur an den Sitzungen teilzunehmen, die Ihren speziellen Bedürfnissen entsprechen. Bei Interesse melden Sie sich bitte für den Kurs in StudIP an (die Kurs-ID lautet 5.WR.1037). Weitere Informationen über den Kurs finden Sie auch im HPC-Wiki.
     
  2. Beantragung von HLRN-Accounts: Wie Sie vielleicht wissen, sind Sie als Angehörige der Universität Oldenburg berechtigt, die High-Performance-Compute-Cluster EMMY und LISE des HLRN zu nutzen. Um dort einen Account zu erhalten, müssen Sie zunächst einen Antrag online ausfüllen und unterschreiben. Der Antrag wird dann über das Institut, bzw. den Fachbereich an den lokalen Berater des HLRN, Stefan Harfst, weitergeleitet. Der genaue Ablauf ist im HPC-Wiki beschrieben.

  3. Tutoren für C++-Programmierkurs gesucht: Dies ist zwar keine dezidiert HPC-bezogene Info, aber der Fachbereich Physik sucht noch Tutoren für den Programmierkurs C++ (pb262, 5.04.255). Wenn Sie Interesse haben, wenden Sie sich bitte an Stefan Harfst für weitere Details. Die Bewerbung ist über den Fachbereich Physik möglich. (Bitte beachten Sie hierzu die Frist)
     
  4. Termine: Die folgenden Termine stehen in naher Zukunft an:
    * Kurs Introduction to HPC: 20. - 22. September, 10:00 - 17:00 Uhr (online)
    * Parallel Programming Workshop: 11. - 15. Oktober (HLRS, online, kostenpflichtig)
    * Meeting der HPC-Nutzervertreter: 24. September, 10:00 Uhr (online)
    * Deadline für HLRN-Anträge: 28. Oktober
     
  5. Software-News: Die folgenden Module stehen ab sofort bereit auf hpc-env/8.3:
  • SALOME/9.7.0-GCCcore-8.3.0-Python-3.7.4
  • ElmerFEM/9.0-foss-2019b
  • canu/2.1.1-GCCcore-8.3.0
  • minimap2/2.22-GCCcore-8.3.0
  • fluka/2021.2.1-Singularity
  • OpenFOAM/9-gimkl-2019b
  • SPAdes/3.15.3-GCC-8.3.0-Python-3.7.4
  • parallel/20210322-GCCcore-8.3.0
  • Biopython/1.78-foss-2019b-Python-3.7.4
  • MCScanX/10.2020-GCCcore-8.3.0
  • FastANI/1.33-GCC-8.3.0
  • Lua/5.3.5-GCCcore-8.3.0
  • osrm-backend/5.25.0-foss-2019b
  • Lumerical/2021-R2.1-2779 *
    *  Alle früheren Versionen werden gelöscht, da sich diese nicht mit dem neuen Lizenzserver verbinden können.
  • und viele weitere Software-Pakete! Werfen Sie also einen Blick auf unsere Software-Seite, falls Sie das eine oder andere benötigen.

Die obige Liste ist möglicherweise nicht vollständig, Sie können jederzeit mit dem Befehl "module spider <softwarename>" nach Software suchen.

Der nächste Newsletter ist für Oktober geplant.

Viele Grüße und  happy Computing!
Ihr HPC-Team

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