Kontakt

Prof. Dr. Thorsten Klüner

Raum: W03 0-034

Tel.: +49 441 798 3681

Fax: +49 441 798 3964

Adresse
Fakultät V
Institut für Chemie
Carl von Ossietzky Universität
Carl-von-Ossietzky-Str. 9 - 11
D-26129 Oldenburg

High-Performance Computing

High-Performance Computing

Die Untersuchung der elektronischen Struktur von Molekülen und die quantendynamische Beschreibung der Bewegung der Kerne während chemischer Reaktionen erfordert eine spezielle Zusammenstellung von leistungsstarker Hardware und effizienter Software.

Hardware

Um Ergebnisse in Bezug auf unsere Forschung in den Schwerpunkten der elektronischen Strukturrechnung und der hoch-dimensionalen Wellenpaketdynamik (siehe auch: Forschung) zu erhalten, stellt der Computer ein unverzichtbares Werkzeug dar.

Die Implementierung wissenschaftlichen Rechnens ist zudem an Rechenressourcen gebunden, die Computersysteme mit hoher Performance, viel Arbeitsspeicher und Speicherkapazität erfordern.

Neben dem kürzlich installierten Linux Cluster System CARL, der auch von verschiedenen anderen Arbeitsgruppen der Fakultäten II und V (siehe:  Central High-Performance Computing - HPC) genutzt wird, stehen unserer Arbeitsgruppe weitere Rechenressourcen exklusiv zur Verfügung. Die folgende Tabelle gibt einen Überblick über diese Ressourcen.


Exklusiv von unserer Arbeitsgruppe verwendete Rechenressourcen:

ServerCPUsKerneRAM (GB)Speicher-
platz (TB)
Verwendung
Eclipse2 x AMD EPYC 7F72 Tetracosacore
@ 3.2 GHz
4820483.7 (SSD)Rechenserver
Fulminatrix2 x AMD EPYC 7F72 Tetracosacore
@ 3.2 GHz
4820483.7 (SSD)        "
      
Orion4 x Intel Cascade Lake Octadecacore
@ 3.1 GHz
7230947.3 (SSD)        "
      
Sulaco2 x Intel Skylake Octadecacore @ 3.0 GHz3615363.4 (SSD)        "
Galileo2 x Intel Skylake Dodecacore @ 2.1 GHz241922.2        "
   
Jacobi1 x Intel Broadwell Octocore @ 3.2 GHz8640.12Entwicklung /
Computer Algebra
   
Lexx2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz161281.2Rechenserver
Equinox2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz161281.2        "
Eagle2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz161281.2        "
Aurora2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz161281.2        "
Pioneer2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz165122.2        "
Voyager2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz165122.2 (SSD)        "
Narada2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz165122.2 (SSD)        "
   
Serenity2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz161282.1        "
Intrepid2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz161282.1        "
Challenger2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz161282.1        "
Falcon2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz161282.1        "
   
Rutile4 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.7 GHz325123.5        "
Antares4 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.7 GHz325123.5        "
Columbia2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz161920.8        "
Eventhorizon2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz161920.8        "
Enterprise2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz161920.8        "
Galactica2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz161920.8        "
      
Endeavour 4 x Intel Westmere Octocore @ 2.0 GHz322560.4        "
Valleyforge   4 x AMD Opteron Octocore @ 2.4 GHz321282.2        "
Darkstar8 x AMD Opteron Quadcore @ 2.6 GHz321280.8        "
Nostromo8 x AMD Opteron Quadcore @ 2.6 GHz321280.8        "
         
Sal90001 x Intel Haswell Quadcore @ 3.4 GHz4322.5File Server / Entwicklung
Hal90001 x Intel Sandybridge Quadcore @ 3.1 GHz480.6File Server / Management
Sandbox    Administration
   
Atlas2 x AMD Opteron Singlecore @ 2.0 GHz240.08File Server
Nemesis2 x AMD Opteron Singlecore @ 1.6 GHz240.2Grafik
Kocmoc2 x AMD Opteron Dualcore @ 2.6 GHz480.16Entwicklung
Hybris2 x AMD Opteron Singlecore @ 1.6 GHz241.1 / 2.2File Server
   
GlomgoldIntel Atom DualCore-D2550225.8 TBBackup Archivierung
ScroogeIntel Atom DualCore-D2550228.6 TBBackup Archivierung
KnoxIntel Atom DualCore-D2550228.6 TBBackup Archivierung
      

Software

Neben der notwendigen Hardware ist die entsprechende Software von entscheidender Bedeutung zur genauen Berechnung, Modellierung und Simulation komplexer Systeme. Die folgende Liste soll eine kurze Referenz der in unserer Arbeitsgruppe verwendeten quantenchemischen Programmpakete liefern.

Quantenchemische Software:

CRYSTAL17

www.crystalsolutions.eu

DYN7D

serielle und parallele Version - entwickelt in unserer Arbeitsgruppe

Gaussian16

gaussian.com/gaussian16/

MOLCAS 8.2

www.molcas.org

MOLPRO2018  

www.molpro.net

ORCA 4.2

orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/portal

MCTDH

www.pci.uni-heidelberg.de/cms/mctdh.html

Weitere wichtige Programme: CP2k, GaussView 6, MOLDEN 5, XCrySDen, VESTA.

 

 

(Stand: 22.07.2021)