Kontakt

Prof. Dr. Thorsten Klüner

Raum:  W03 0-034

Tel.: +49 441 798 3681

Fax: +49 441 798 3964

Adresse
Fakultät V
Institut für Chemie
Carl von Ossietzky Universität
Carl-von-Ossietzky-Str. 9 - 11
D-26129 Oldenburg

High-Performance Computing

High-Performance Computing

Die Untersuchung der elektronischen Struktur von Molekülen und die quantendynamische Beschreibung der Bewegung der Kerne während chemischer Reaktionen erfordert eine spezielle Zusammenstellung von leistungsstarker Hardware und effizienter Software.

Hardware

Um Ergebnisse in Bezug auf unsere Forschung in den Schwerpunkten der elektronischen Strukturrechnung und der hoch-dimensionalen Wellenpaketdynamik (siehe auch: Forschung) zu erhalten, stellt der Computer ein unverzichtbares Werkzeug dar.

Die Implementierung wissenschaftlichen Rechnens ist zudem an Rechenressourcen gebunden, die Computersysteme mit hoher Performance, viel Arbeitsspeicher und Speicherkapazität erfordern.

Neben dem kürzlich installierten Linux Cluster System CARL, der auch von verschiedenen anderen Arbeitsgruppen der Fakultäten II und V (siehe:  Central High-Performance Computing - HPC) genutzt wird, stehen unserer Arbeitsgruppe weitere Rechenressourcen exklusiv zur Verfügung. Die folgende Tabelle gibt einen Überblick über diese Ressourcen.


Exklusiv von unserer Arbeitsgruppe verwendete Rechenressourcen:

Server CPUs RAM (GB) Speicher-
platz (TB)
Verwendung
Fulminatrix 2 x AMD EPYC 7F72 Tetracosacore
@ 3.2 GHz
1024 3.7 (SSD) Rechenserver
         
Orion 4 x Intel Cascade Lake Octadecacore
@ 3.1 GHz
3094 7.3 (SSD)         "
         
Sulaco 2 x Intel Skylake Octadecacore @ 3.0 GHz 1536 3.4 (SSD)         "
Galileo 2 x Intel Skylake Dodecacore @ 2.1 GHz 192 2.2         "
   
Jacobi 1 x Intel Broadwell Octocore @ 3.2 GHz 64 0.12 Entwicklung /
Computer Algebra
   
Lexx 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 128 1.2 Rechenserver
Equinox 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 128 1.2         "
Eagle 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 128 1.2         "
Aurora 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 128 1.2         "
Pioneer 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 512 2.2         "
Voyager 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 512 2.2 (SSD)         "
Narada 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 512 2.2 (SSD)         "
   
Serenity 2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz 128 2.1         "
Intrepid 2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz 128 2.1         "
Challenger 2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz 128 2.1         "
Falcon 2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz 128 2.1         "
   
Rutile 4 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.7 GHz 512 3.5         "
Antares 4 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.7 GHz 512 3.5         "
Columbia 2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz 192 0.8         "
Eventhorizon 2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz 192 0.8         "
Enterprise 2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz 192 0.8         "
Galactica 2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz 192 0.8         "
         
Endeavour 4 x Intel Westmere Octocore @ 2.0 GHz 256 0.4         "
Valleyforge   4 x AMD Opteron Octocore @ 2.4 GHz 128 2.2         "
Darkstar 8 x AMD Opteron Quadcore @ 2.6 GHz 128 0.8         "
Nostromo 8 x AMD Opteron Quadcore @ 2.6 GHz 128 0.8         "
            
Sal9000 1 x Intel Haswell Quadcore @ 3.4 GHz 32 2.5 File Server / Entwicklung
Hal9000 1 x Intel Sandybridge Quadcore @ 3.1 GHz 8 0.6 File Server / Management
Sandbox       Administration
   
Atlas 2 x AMD Opteron Singlecore @ 2.0 GHz 4 0.08 File Server
Nemesis 2 x AMD Opteron Singlecore @ 1.6 GHz 4 0.2 Grafik
Kocmoc 2 x AMD Opteron Dualcore @ 2.6 GHz 8 0.16 Entwicklung
Hybris 2 x AMD Opteron Singlecore @ 1.6 GHz 4 1.1 / 2.2 File Server
   
Glomgold Intel Atom DualCore-D2550 2 5.8 TB Backup Archivierung
Scrooge Intel Atom DualCore-D2550 2 8.6 TB Backup Archivierung
Knox Intel Atom DualCore-D2550 2 8.6 TB Backup Archivierung
         

Software

Neben der notwendigen Hardware ist die entsprechende Software von entscheidender Bedeutung zur genauen Berechnung, Modellierung und Simulation komplexer Systeme. Die folgende Liste soll eine kurze Referenz der in unserer Arbeitsgruppe verwendeten quantenchemischen Programmpakete liefern.

Quantenchemische Software:

CRYSTAL17

www.crystalsolutions.eu

DYN7D

serielle und parallele Version - entwickelt in unserer Arbeitsgruppe

Gaussian16

gaussian.com/gaussian16/

MOLCAS 8.2

www.molcas.org

MOLPRO2018  

www.molpro.net

ORCA 4.2

orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/portal

MCTDH

www.pci.uni-heidelberg.de/cms/mctdh.html

Weitere wichtige Programme: CP2k, GaussView 6, MOLDEN 5, XCrySDen, VESTA.

 

 

(Stand: 03.11.2020)