Kontakt

Prof. Dr. Thorsten Klüner

Raum:  W03 0-034

Tel.: +49 441 798 3681

Fax: +49 441 798 3964

Adresse
Fakultät V
Institut für Chemie
Carl von Ossietzky Universität
Carl-von-Ossietzky-Str. 9 - 11
D-26129 Oldenburg

High-Performance Computing

Die Untersuchung der elektronischen Struktur von Molekülen und die quantendynamische Beschreibung der Bewegung der Kerne während chemischer Reaktionen erfordert eine spezielle Zusammenstellung von leistungsstarker Hardware und effizienter Software.

Hardware

Um Ergebnisse in Bezug auf unsere Forschung in den Schwerpunkten der elektronischen Strukturrechnung und der hoch-dimensionalen Wellenpaketdynamik (siehe auch: Forschung) zu erhalten, stellt der Computer ein unverzichtbares Werkzeug dar.

Die Implementierung wissenschaftlichen Rechnens ist zudem an Rechenressourcen gebunden, die Computersysteme mit hoher Performance, viel Arbeitsspeicher und Speicherkapazität erfordern.

Neben dem kürzlich installierten Linux Cluster System ROSA, der auch von verschiedenen anderen Arbeitsgruppen der Fakultäten II und V (siehe:  Central High-Performance Computing - HPC) genutzt wird, stehen unserer Arbeitsgruppe weitere Rechenressourcen exklusiv zur Verfügung. Die folgende Tabelle gibt einen Überblick über diese Ressourcen.


Exklusiv von unserer Arbeitsgruppe verwendete Rechenressourcen:

Server CPUs Kerne RAM (GB)

Speicher
-platz (TB)

Verwendung
Dauntless 2 x AMD EPYC 7F72 Tetracosacore @ 3.2 GHz 48 1024 8.0 (SSD) Rechenserver
Enigma 2 x AMD EPYC 7F72 Tetracosacore @ 3.2 GHz 48 2048 14.0 (SSD)         "
Eclipse 2 x AMD EPYC 7F72 Tetracosacore @ 3.2 GHz 48 2048 3.7 (SSD)         "
Fulminatrix 2 x AMD EPYC 7F72 Tetracosacore @ 3.2 GHz 48 2048 3.7 (SSD)         "
           
Orion 4 x Intel Cascade Lake Octadecacore @ 3.1 GHz 72 3094 7.3 (SSD)         "
           
Sulaco 2 x Intel Skylake Octadecacore @ 3.0 GHz 36 1536 3.4 (SSD)         "
Galileo 2 x Intel Skylake Dodecacore @ 2.1 GHz 24 192 2.2         "
     
Jacobi 1 x Intel Broadwell Octocore @ 3.2 GHz 8 64 0.12 Entwicklung /
Computer Algebra
     
Lexx 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 16 128 1.2 Rechenserver
Equinox 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 16 128 1.2         "
Eagle 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 16 128 1.2         "
Aurora 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 16 128 1.2         "
Pioneer 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 16 512 2.2         "
Voyager 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 16 512 2.2 (SSD)         "
Narada 2 x Intel Haswell Octocore @ 3.2 GHz 16 512 2.2 (SSD)         "
     
Serenity 2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz 16 128 2.1         "
Intrepid 2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz 16 128 2.1         "
Challenger 2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz 16 128 2.1         "
Falcon 2 x Intel Ivybridge Octocore @ 2.6 GHz 16 128 2.1         "
     
Rutile 4 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.7 GHz 32 512 3.5         "
Antares 4 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.7 GHz 32 512 3.5         "
Columbia 2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz 16 192 0.8         "
Eventhorizon 2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz 16 192 0.8         "
Enterprise 2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz 16 192 0.8         "
Galactica 2 x Intel Sandybridge Octocore @ 2.6 GHz 16 192 0.8         "
           
Endeavour 4 x Intel Westmere Octocore @ 2.0 GHz 32 256 0.4         "
Valleyforge   4 x AMD Opteron Octocore @ 2.4 GHz 32 128 2.2         "
Darkstar 8 x AMD Opteron Quadcore @ 2.6 GHz 32 128 0.8         "
Nostromo 8 x AMD Opteron Quadcore @ 2.6 GHz 32 128 0.8         "
              
Sal9000 1 x AMD EPYC 7351 Hexadecacore @ 2.4 GHz 16 64 2.5 File Server / Entwicklung
Hal9000 1 x Intel Sandybridge Quadcore @ 3.1 GHz 4 8 0.6 File Server / Management
Sandbox         Administration
     
Atlas 2 x AMD Opteron Singlecore @ 2.0 GHz 2 4 0.08 File Server
Nemesis 2 x AMD Opteron Singlecore @ 1.6 GHz 2 4 0.2 Grafik
Kocmoc 2 x AMD Opteron Dualcore @ 2.6 GHz 4 8 0.16 Entwicklung
Hybris 2 x AMD Opteron Singlecore @ 1.6 GHz 2 4 1.1 / 2.2 File Server
     
Glomgold Intel Atom DualCore-D2550 2 2 5.8 TB Backup Archivierung
Scrooge Intel Atom DualCore-D2550 2 2 8.6 TB Backup Archivierung
Knox Intel Atom DualCore-D2550 2 2 8.6 TB Backup Archivierung
           

Software

Neben der notwendigen Hardware ist die entsprechende Software von entscheidender Bedeutung zur genauen Berechnung, Modellierung und Simulation komplexer Systeme. Die folgende Liste soll eine kurze Referenz der in unserer Arbeitsgruppe verwendeten quantenchemischen Programmpakete liefern.

Quantenchemische Software:

CRYSTAL17

www.crystalsolutions.eu

DYN7D

serielle und parallele Version - entwickelt in unserer Arbeitsgruppe

Gaussian16

gaussian.com/gaussian16/

MOLCAS 8.2

www.molcas.org

MOLPRO2023 

www.molpro.net

ORCA 5.0

orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/portal

MCTDH

www.pci.uni-heidelberg.de/cms/mctdh.html

Weitere wichtige Programme: CP2k, GaussView 6, MOLDEN 5, XCrySDen, VESTA.

 

 

(Stand: 20.06.2024)  | 
Zum Seitananfang scrollen Scroll to the top of the page