Der Bewerbungs- und Auswahlprozess gestaltet sich folgendermaßen:

1. Bewerbungen werden ausschließlich während der Bewerbungsfristen (siehe rechts) entgegengenommen. Das Anschreiben ist an die Hochschulleitung zu richten, die Unterlagen aber sind — per Online-Formular — bei der Servicestelle Stipendien einzureichen.
2. Nach Ende der Bewerbungsfrist werden die Unterlagen durch die Heinz Neumüller Stiftung  geprüft.
3. Der Vorstand der Heinz Neumüller Stiftung trifft eine Auswahl von Bewerberinnen und Bewerber und schlägt diese dem Kuratorium zur Entscheidung vor.
4. Das Kuratorium wählt die Stipendiatinnen und Stipendiaten für das kommende Jahr aus.
5. Abschließend erhalten die Bewerberinnen und Bewerber vom Vorstand der Heinz Neumüller Stiftung einen positiven oder negativen Bescheidung zu ihrer Bewerbung.
6. Zu Beginn des nächsten Jahres beginnt die Förderung.
7. Bei einer gemeinsamen Veranstaltung im kleinen Rahmen werden die Stipendien im ersten Quartal des Förderungsjahres feierlich übergeben.