Nach §45 NHG sind die zuständigen Studienkommissionen vor den Entscheidungen des Fakultätsrates in allen Angelegenheiten der Lehre, des Studiums und der Prüfungen zu hören. Der Fakultätsrat hat ihre Empfehlungen zu würdigen und seine Stellungnahme zu dokumentieren; er kann einzelne Entscheidungen auf eine zuständige Studienkommission übertragen.

Die Studienkommission der Fakultät VI ist für alle Angelegenheiten der Lehre, des Studiums und der Prüfungen des Modellstudiengangs Humanmedizin sowie für die Masterstudiengänge Neurocognitive Psychology, Molecular Biomedicine, Advanced Nursing Practice, Data Science, Neuroscience und Versorgungsforschung und den Promotionsstudiengang Neurosensory Science and Systems zuständig.

Zudem gibt es eine fakultätsübergreifende Studienkommission.