Fabian Otto-Sobotka

Fabian Otto-Sobotka

Epidemiologie und Biometrie  (» Postanschrift)

V03 A106 (» Adresse und Lageplan )

nach Vereinbarung

+49 441 798-4476  (F&P

Forschungsschwerpunkte

  • Expektil- und Quantilregression
  • GAMLSS
  • Boosting
  • Semiparametrische Modelle
  • Longitudinale Daten und gemischte Modelle
  • Ereigniszeitanalysen
  • Instrumentalvariablen
  • Graphische Modelle

Lebenslauf

Qualifikationen

  • 01/2018: Zertifikat zur hochschuldidaktischen Qualifizierung an der Universität Oldenburg
  • 03/2012: Promotion zum Thema "Semiparametric Expectile Regression" an der Universität Oldenburg
  • 04/2009: Diplom der Mathematik zum Thema "Validierung ungerichteter graphischer Modelle" am BIPS / Universität Bremen

Werdegang

  • seit 10/2014: Wissenschaftlicher Mitarbeiter (bis 02/18 Akademischer Rat) am Lehrstuhl für Epidemiologie und Biometrie im Department für Versorgungsforschung der Universität Oldenburg
  • 20122014: Akademischer Rat am Lehrstuhl für Statistik im Department für Wirtschaftswissenschaften der Universität Göttingen
  • 20092012: Wissenschaftlicher Mitarbeiter am Institut für Mathematik der Universität Oldenburg
  • 20032009: Studium der Mathematik an den Universitäten Kaiserslautern und Bremen

Aktuelle Projekte

Publikationen

  • de Sordi D, Kappen S, Otto-Sobotka F, Gutierrez L, Fortuny J, Reinold J, Schink T, Timmer A. Validity of hospital Icd‐10‐Gm-codes to identify Anaphylaxis.  ISPE September 2020 ICPE; 14.09.2020.
  • de Sordi D, Kappen S, Otto-Sobotka F, Kulschewski A, Weyland A, Gutierrez L, Fortuny J, Reinold J, Schink T, Timmer A. Validity of Hospital ICD-10-GM Codes to Identify Anaphylaxis. Pharmacoepidemiology and Drug Saf. 2021;12:1643–1652.
  • Otto-Sobotka, F. Semiparametrische Verteilungsregression.  Oberseminar "Neuere Methoden der Biometrie"; 17.01.2018; Institut für Biometrie und Klinische Forschung, Universität Münster 2018.
  • Otto-Sobotka, F. Communicating distributional regression results to applied scientists. GMDS; 10.09.2019; Dortmund.
  • Otto-Sobotka, F. Semiparametric Accelerated Failure Times Quantile and Expectile Regression using Auxiliary Likelihoods. DAGStat; 20.03.2019; München.
  • Kappen S, Otto-Sobotka, F, Seipp A. Vorstellung aktueller Projekte: PSA-Testung als Früherkennungsuntersuchung, Verteilungsregression von Patientenoutcomes, Verteilungsregression für Ereigniszeiten. Kolloquium des Departments für Versorgungsforschung; 24.09.2018; Universität Oldenburg 2018.
  • Löffler BS, Stecher HI, Fudickar S, de Sordi D, Otto-Sobotka F, Hein A, Herrmann CS. Counteracting the Slowdown of Reaction Times in a Vigilance Experiment With 40 Hz Transcranial Alternating Current Stimulation. Transactions on Neural Systems & Rehabilitation Engineering. 2018;26(10):2053–2061.
  • Otto-Sobotka F, Mirkov, R., Hofner, B., Kneib, T. Modelling Flow in Gas Transmission Networks Using Shape-Constrained Expectile Regression. In: Daouia A, Ruiz-Gazen, A., editor. Advances in Contemporary Statistics and Econometrics. Cham: Springer; 2021.
  • Otto-Sobotka F, Peplies J, Timmer A. Modeling determinants of satisfaction with health care in youth with inflammatory bowel disease Part 2: semiparametric distributional regression. Clinical epidemiology. 2019;11:403.
  • Otto-Sobotka F, von Gablenz P, Holube I. Distributional regression of self-reported hearing abilities in the HÖRSTAT study. GMDS; 17.09. –21.09.2017; Oldenburg: German Medical Science GMS Publishing House; 2017.
  • Otto-Sobotka F, de Sordi D. Introduction to R. Workshop. GMDS; 17.09.-21.09.2017; Oldenburg 2017.
  • Otto-Sobotka F, Salvati N, Ranalli MG, Kneib T. Adaptive Semiparametric M-Quantile Regression. Econometrics and Statistics. 2019;11:116–129.
  • Roeper J, Falk M, Chalaris-Rissmann A, Lueers A, Wedeken K, Stropiep U, et al. TP53 co-mutations in EGFR mutated patients in NSCLC stage IV: A strong predictive factor of ORR, PFS and OS in EGFR mt+ NSCLC. Oncotarget. 2020;11(3):250–264.
  • Seipp A, Klausen A, Timmer A, Grimm T, Groß M, Summ O, Otto-Sobotka F. Effect of mechanical insufflation-exsufflation for ineffective cough on weaning duration in diseases of the peripheral or central nervous system (MEDINE): study protocol for a randomised controlled trial in a neurological weaning centre. BMJ Open. 2023;13(7):e071273.
  • Seipp A, Uslar V, Weyhe D, Timmer A, Otto-Sobotka F. Weighted expectile regression for right-censored data. Statistics in Medicine. 2021;40(25):5501–5520.
  • Seipp A, Uslar V, Weyhe D, Timmer A, Otto-Sobotka F. Flexible semiparametric mode regression for time-to-event data. Statistical Methods in Medical Research. 2022;31(12):2352–2367.
  • Seipp A, Otto-Sobotka F. Weighted Expectile Regression for Right-Censored Data. ZeSOB Doktorandenkolloquium; 30.09.2019; Bremen.
  • Seipp A, Otto-Sobotka F. Mode Regression for Overall Survival of Pancreatic Cancer Patients. ZeSOB Doktorandenkolloquium; 29.09.2020.
  • Seipp A, Otto-Sobotka F. dirttee: Distributional Regression for Time to Event Data. R package version 1.0. 2022.
  • Seipp A, Uslar V, Timmer A, Otto-Sobotka F. Mode Regression in Survival Analysis. GMDS; 06.09.2020.
  • Spiegel E, Kneib T, Otto-Sobotka F. Generalized additive models with flexible response functions. F Stat Comput. 2017:1–16.
  • Spiegel E, Kneib T, Otto-Sobotka F. Spatio-temporal expectile regression models. Statistical Modeling. 2019;20(4):386–409.
  • Spiegel E, Kneib T; von Gablenz, P; Otto-Sobotka, F. Generalized expectile regression with flexible response function Biometrical Journal. 2021;63(5):1028–1051.
  • Timmer A, de Sordi D, Menke E, Peplies J, Classen M, Koletzko S, Otto-Sobotka F. Modeling determinants of satisfaction with health care in youth with inflammatory bowel disease: a cross-sectional survey. Clinical Epidemiology. 2018;10:1289–1305.
  • Timmer A, Neuser J, Uslar V, de Sordi D, Kappen S, Seipp A, Tiles-Sar N, Beckhaus J, Otto-Sobotka F. Wissenschaftsausbildung im Medizinstudium: Das Oldenburger Datenanalyseprojekt als Umsetzungsbeispiel [Lessons learned]. GMS Med Inform Biom Epidemiol. 2023;19(Doc11).
  • Timmer A, Neuser J, Uslar V, de Sordi D, Kappen S, Seipp A, Tiles-Sar N, Beckhaus J, Otto-Sobotka F. Science education in medical school: the Oldenburg data analysis project as an implementation example [Lessons learned]. GMS Med Inform Biom Epidemiol. 2023;19(Doc11).
  • von Gablenz P, Otto-Sobotka F, Holube I. Sprachverstehen nach Selbsteinschätzung und im Göttinger Satztest in der Allgemeinbevölkerung. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Audiologie (DGA); 28.02. –03.03.2018; Halle (Saale) 2018.
  • von Gablenz P, Otto-Sobotka F, Holube I. Adjusting Expectations: Hearing Abilities in a Population-Based Sample Using an SSQ Short Form. Trends Hear. 2018;22:2331216518784837.
  • Weyhe D, Seipp A, Uslar V, Timmer A, Otto-Sobotka F. Outcome-Analyse mithilfe von Quantilregression bei 1028 Patienten mit kolorektalem Karzinom. Zeitschrift für Gastroenterologie. 2019;57(09):KV 310.
  • Wirsik N, Otto-Sobotka F, Pigeot I. Modeling physical Activity using L0-penalised expectile regression. Biometrical Journal. 2019;61(6):1371–1384.
  • Zeleke A, Worku A, Demissie A, Otto-Sobotka F, Wilken M, Lipprandt M, et al. Evaluation of Electronic and Paper Pen Data Capturing Tools for Data Quality in a Public Health Survey in a Health and Demographic Surveillance Site, Ethiopia: A randomized controlled crossover Healthcare IT-Evaluation. JMIR MHealth and Uhealth. 2019;7(2):e10995.

Alle aktuellen Publikationen und Konferenzbeiträge finden Sie unter Publikationen.

Frühere Publikationen

Lehre

Aktuelle Lehrveranstaltungen können unter Lehre eingesehen werden.

 

Die aktuellen Veranstaltungen richten sich an Masterstudenten in den ersten Semestern, die in ihrem Studium und weiteren Verlauf ihrer Arbeiten auf statistische Grundkenntnisse zurückgreifen wollen. Grundlegende statistische Analysen werden vermittelt und mit Hilfe der Software R angewendet.

Semester Titel Ort Zeit

SoSe 

 

WiSe 

 

Datenanalyseprojekt  im zweiten Jahr Medizin

 

Foundations of STS: Statistics and Programming

Übung

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Mo 10–12

Do 10–12

Links

  • R-Paket expectreg (Sobotka, Schnabel, Schulze Waltrup unter Mitwirkung von Eilers, Kneib, Kauermann)
  • R-Paket gmvalid (Sobotka, Foraita)
  • R-Paket FlexGAM (Spiegel)
  • R-Paket dirttee (Seipp, Otto-Sobotka)
(Stand: 19.01.2024)  | 
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